1981-ci il aprelin 13-də Bakı şəhərində anadan olub. 10 yaşından futbolla məşğul olub. 2001-ci ildə “Dinamo”da peşəkar futbol karyerasına başlayıb. Elxan Ağayev 2010-cu ilə qədər “Ümid”, “Karat”, “Göyəzən”, MOİK, “Bakılı” və “Rəvan” klublarında qapıçı mövqeyində çıxış edib. Zədə səbəbindən futbolçu karyerasını başa vuraraq məşqçiliyə başlayıb.

UEFA-nın “C” kateqoriyalı məşqçilik lisenziyasına malikdir.