Агиль Мамедов родился 1 мая 1989 года в селе Абрагунус Джульфинского района Нахчыванской Автономной Республики.
Является воспитанником клуба «Бакы». В профессиональной карьере защищал цвета «Бакы», «Нефтчи», AZAL и «Габалы», а также выступал за молодёжную (U-21) и национальную сборные Азербайджана. За годы игровой карьеры дважды становился чемпионом Азербайджана и дважды завоёвывал Кубок страны.
В 33 года завершил игровую карьеру в «Нефтчи» и начал тренерскую деятельность в футбольной академии клуба.
Является обладателем тренерской лицензии UEFA категории C.